Nicméně musím říct že systém na ITISu je v řadě částí také velice zastaralý.

No a k těm obojživelníkům - většina ostatních systému je jiná protože mají často zjednodušené členění jen na řády/čeledi/druhy a mají jen recentní taxony. Jakmile chceme mít v systému i vyhynulé taxony je většinou nutné je zapojit nějak složitěji.

Systém obojživelníků jsem zpracoval nejdříve já české druhy, pak se do toho pustil Michal, myslím podle Svět zvířat VII - Obojživelníci, plazi, ale nevím zda je to jediný zdroj. Pak to nějakým (tenkrát jsem s ním moc nesouhlasil) způsoběm zapojil do vyšší hierarchie jako podtřídu, ačkoliv na většině míst to mají jako třídu, někde jako klad bez kategorie.

Pokud mi poradíte podle čeho to předělat, rád se do toho pustím.

Jiří Novák [ 31.01.2006 12:50:22 ]: Na Wikipedii jsem v nějakém diskusním fóru četl přibližně takovouto zprávu nějaké wikipedistky (správce): "Prosím Tě ... kde jsi vyhrabal ten systém obojživelníků? Takový je jedině na Biolibu, všude jinde na světě se používá jiný, je lepší držet se názoru většiny". Najít to znovu neumím, protože jména wikipedistů si nepamatuji a nedávám tomu ani velký význam. Správnost systému nižších kategorií (nadčeleď a níže) se řídí nomenklatorickými pravidly (ne většinou!), vyčmuchat, které jméno taxonu je platné je dost složitá věc, ale já se držím předpokladu, že to již vyčmuchali a zveřejnili na ITIS. Jména vyššího systému jsou volnější a je věcí názoru toho či onoho autora jak to rozškatulkuje. Systém na Biolibu nikdy nebude dokonalý, ale asi by bylo dobré u jednotlivých skupin uvádět zdroj informací, aby bylo možné snadno posoudit, který zdroj je novější (= správnější).

No ono by stačilo prozradit, který systém je ten pravý a na biolibu to opravit.
BTW, kde se to na wikipedii píše?

Systém obojživelníků dělal Michal, já dělal jen ty české.

Možná mimo jiné v tom že náš není kompletní.
Kdo ho dělal?
A jaký se teda používa jinde ve světě?

Jiří Novák [ 30.01.2006 12:26:00 ]: Na české Wikipedii zase psali, že všude jinde na světě používají jiný systém obojživelníků než na Biolibu. V čem byl problém jsem nezjišťoval.

Na wikipedii bacha. Tam v tom mají dost binec. Raději všechno dvakrát ověřit.

Plži (Gastropoda) dáni do pořádku podle anglické Wikipedie http://en.wikipedia.org/w/index.php?titl.... (do úrovně nadčeleďi).

Problémy:
Aciculoidea
Murchisoniina
Heterobranchia/Valvatoidea nebo Ectobranchia/Valvatoidea
Pteropoda
Physoidea
Clausilioidea AUTORITA
Limacoidea AUTORITA
velice podezřelý taxon Holopodes
Bulimuloidea

Kompletně jsem přepracoval zneplatňování taxonů, věnujte prosím pozornost novému textu nápovědy

Zneplatnění taxonu (označení duplicity)

Vím že je to možná trochu nesrozumitelné, nejsem žádný spisovatel a ještě navíc je mi ta věc tak jasná, že mne nenapadá co o ní více napsat. Zeptejte se na cokoliv čemu byste nerozuměli.

Ještě bych rád zdůraznil, že pokud nějaký taxon v BioLibu existuje pod starým jménem/zařazením, a ne pod novým, správný postup je ho přejmenovat popř. přesunout, a ne založit taxon nový a ten starý zneplatnit. Tím se v databázi zakládájí zbytečné záznamy které celou databázi zvětšují a zpomalují. Funkce pro označování duplicit se používá pouze v případech, že v BioLibu už existují dva taxony, které jsou ve skutečnosti jen jeden.

Je mi jasné že čas od času někdo založí záznam, a pak teprve dodatečně zjistí že už tam byl pod jiným názvem a bez synonym. Stává se to i mně. V takovém případě se označení duplicit použít musí. Ale nemělo by to být pravidlo, zkuste prosím pokud je to jen trochu možné podívat se před založením taxonu zda tam už pod některým starším názvem nemůže existovat.

Ještě jsem doplnil do nápovědy o zneplatňování odstaveček o tom, proč by se měly označovat jako neplatné taxony nověji založené a ne ty staré, i když mají neplatný název.

Když má nějaký taxon starý název, je potřeba k němu doplnit platný, starý nechat jako synonymum, a celý taxon přesunout do správného rodu (a ne založit nový a ten starý označit jako duplicitní k novému). Já časem udělám to zneplatňování taxonu přehlednější a automatičtější, aby se takovéhle věci tolik nestávaly, do teď k tomu nebyla nápověda, takže to sem tam někdo použil jinak než jsem si představoval. Moje chyba :)

Nové nápovědné texty pro administrátory taxonomie

- Hromadné zakládání podtaxonů

- Zneplatnění taxonu

Jinak k tomu konvertování synonym - nyní když dáte editovat latinské synonymum, ve formuláři je od teď nová funkce "Konvertovat synonymum na platný taxon", stačí stisknout tlačítko "OK" a potvrdit otázku, a synonymum se automaticky konvertuje na platný název nově založeného taxonu, který je zařazen pod stejným taxonem co původní taxon.

Jiří Berkovec [ 09.01.2006 20:28:32 ]: Při výběru jazyka odkazu to okno funguje trochu jinak než při výběru jednoho ID - okno se nezavře po zaškrtnutí jazyka, ale lze jich vybrat více, a potvrdit tlačítkem OK na konci stránky. Slouží to pro přidávání odkazů na vícejazyčné stránky (vlaječky se potom zobrazují i u taxonu ke kterému je odkaz přidán, viz. např. Ichneumonidae). I když tedy je i možné že tam nefunguje něco jiného, kdyžtak mi tu chybu popiš do pošty, kdyby to dál nešlo vybírat.

Jiří Berkovec [ 09.01.2006 13:45:03 ]: To zatím BioLib nepodporuje, ale taky už jsem nad tím přemýšlel, že by u synonyma mohla být funkce, která by název přesunula pod rodiče taxonu ke kterému patří a založila pod ním nový profil. Zapíšu si to jako prioritu.

Jiří Berkovec [ 09.01.2006 14:15:25 ]: Tohle jsem moc nepochopil, akorát jsem našel u lumků smazaný odkaz na nějaké stránky o houbách, napadlo mne, jestlis tam nezadával číslo nepotvrzeného odkazu (protože ten odkaz o lumcích potvrzoval Jirka Novák). Záznamy lze provazovat pouze s jinými potvrzenými záznamy.
Teď by to mělo být v pořádku: Ichneumonidae.

Wahl (1990)rozdělil podčeleď Microleptinae = syn. Oxytorinae na dvě podčeledi Microleptinae a Oxytorinae (obsahuje pouze rod Oxytorus). Jak se to v systému opraví, aby se nemuselo jméno synonymu mazat?

- hromadné přidávání taxonů na žádost přesunuto z "Akce s podtaxony" do "Přidat", které jsem na jinou žádost přejmenoval na "Přidat taxon"... doufám že tímto jsou žádosti na podobné změny vyčerpány, jinak si nikdo ze správců nebude pamatovat co kde je :)

- v Akce s podtaxony přibylo tlačítko, pomocí kterého lze zrušit třízení v editovaném taxonu, tj. podtaxony se budou řadit abecedně. Funguje jen pro taxony které jsou přímí následnící editovaného taxonu, celou větev můžu automaticky seřazovat pouze já, a je to akce bez možnosti návratu... Seřadil jsem abecedně houby, protože vím docela jistě že tam žádné třízení nebylo. Když bude potřeba setřídit nějakou jinou celou větev, dejte mi vědět. Než budete nějaké podtaxony setřizovat, zamyslete se nad tím, jestli nemá současné pořadí nějaký význam - uspořádání se projevuje i ve stromu, takže v něm jsou vidět např. Prokaryota před Eukaryotae, ačkoliv být to jen abecedně, bylo by to naopak.

Jiří Berkovec [ 04.01.2006 21:04:20 ]: Je tam "mihule", na BioLib už jsem to přidal. Ryby jsou jediný seznam českých jmen co mám k dispozici v PDF, dá se stáhnout z internetu, např. zde http://www.aquatab.net/articles/ceske-na.... Právě jsem podle něj mihule, sliznatky a paryby dodělával, to jste si asi všimnuli, teď ještě musím dodělat opravy první části co jsou v druhém dílu a pak se pustit do ryb, s tím automatickým zakládáním rodů to jde skoro samo. Až tam bude systém, vymyslím jak z toho importovat i české názvy, ale není to jednoduché, protože PDF není zrovna vhodný formát ke kopírování textu (což autorům pochopitelně nemohu mít za zlé, že).

Škoda že nemám v elektronické podobě i jiné seznamy živočichů...

Dokonce je to zdá se nejjednodušší způsob jak přidat do BioLibu druh z nového rodu, jak to tak zkouším. Nemusí se to tedy využívat pouze na hromadné zakládání.

Má to samozřejmě nevýhodu že ten rod se založí bez autority, ale ono stejně málokdo autoritu k rodům při zakládání přidává (což nevadí, takovéhle věci se budou spíše řešit časem při nějakých importech dat). Ale u druhů by to autority chtělo, pokud je to jen trochu možné.

- vylepšil jsem funkci Hromadné založení taxonů o možnost automaticky zakládat rody pro druhy, takže když teď chci přidat z nějakého seznamu druhů, např.

Cirrhigaleus barbifer Tanaka, 1912
Pseudocentrophorus isodon Chu, Meng & Liu, 1981
Squalus acanthias Linnaeus, 1758
Squalus acutirostris Chu, Meng & Li, 1984
Squalus asper Merrett, 1973
Squalus cubensis Howell Rivero, 1936
Squalus japonicus Ishikawa, 1908
Squalus megalops Macleay, 1881
Squalus melanurus Fourmanoir & Rivaton, 1979
Squalus mitsukurii Jordan & Snyder in Jordan & Fowler, 1903
Squalus rancureli Fourmanoir & Rivaton, 1979

stačí řádky zkopírovat do pole ve funkci Akce s podtaxony v příslušné čeledi, zaškrtnout políčko "Automatické založení rodů" a potvrdit. Kontroluje, zda rody už neexistují. Pokud už v čeledi nějaké rody ze seznamu jsou, taxony se automaticky nezatřídí, na což si je třeba dávat pozor a přidávat je zvlášť. Ono jestli je tam rod stejný jako v tom seznamu, tak to beztak nahlásí duplicitu (která ovšem jde ignorovat, ale nedělejte to pokud si nejste úplně jistí), takže se nemůže stát, že byste nějaký rod přehlédli a on se tam založil duplicitně.

- názvy které se zobrazují na profilu (ať už synonyma, vedlejší názvy v nastaveném jazyce, nebo názvy v alternativních jazycích) je možné přímo odtamtad nastavit jako hlavní, bez nutnosti přecházet do funkce Taxon - názvy.

- a tohle jistě řada z vás ocení: při přidávání taxonu (i nepotvrzeného) se teď automaticky nabízí ne nejvyšší nižší taxonomická kategorie (než taxon ke kterému je přidáváno), ale nejvyšší "běžná" kategorie, tedy např. k rodu druh, a ne podrod jak to bylo předtím, k čeledi rod, a ne podčeleď atp. Volbu je samozřejmě možné změnit.