BioLib umožňuje taxony v databázi označit jako duplicitní k nějakému jinému taxonu.

Při přidávání dat se často stane, že nějaký taxon se založí dvakrát pod různými jmény (některé taxony mají více neplatných synonym). Pokud administrátoři takovou duplicitu objeví, taxon není smazán, ale speciálně označen, takže pokud se na něj odkazovala jiná stránka (popř. výsledky hledání v nějakém vyhledávači), uživatel se nedostane na chybovou stránku, ale je automaticky přesměrován na platný profil.

Zpravidla se ruší taxon s vyšším ID, tedy ten později založený.

Veškeré vazby s obrázky, názvy, texty atd. se přesunou na ponechaný taxon.

Taxony označené jako duplicitní se neobjevují ve výsledcích hledání ani v rejstřících atp., narozdíl od taxonů, které jsou pouze označené jako nezařazené do systému BioLibu.

Najít duplicity je samozřejmě složité a navíc se tím zbytečně zabírá místo v databázi, proto je třeba snažit se vyhnout se zakládání duplicit už při přidávání taxonů. Při přidávání taxonu se automaticky provádí kontrola, zda už název neexistuje v jiné části databáze, třeba i jako synonymum. Vhodné je také přidat k nově založenému taxonu více synonym, pokud se během jejich přidávání zjistí, že už taxon v databázi existuje, správci z nově založeného taxonu pouze doplní chybějící informace a nebudou ho zakládat znovu.