Stratigrafické období - taxony
podčeleď Dytiscinae Leach, 1815 (priabon - recent)
rod Dytiscus Linnaeus, 1758 - potápník (střední miocén - recent)
druh Dytiscus avunculus von Heyden, 1862 (svrchní miocén)
druh Dytiscus latahensis Wickham, 1931 (střední miocén)
druh Dytiscus lavateri Heer, 1847 (střední miocén)
kmen Echinodermata Bruguière, 1791 - ostnokožci (spodní kambrium - recent)
třída Echinoidea Leske, 1778 - ježovky (ordovik - recent)
druh Echinolampas gambierensis Tenison Woods, 1867 (spodní miocén)
druh Echinolampas morgani Cotteau, 1860 (spodní miocén)
čeleď Ectobiidae Brunner von Wattenwyl, 1865 - rusovití (seland - recent)
podčeleď Ectobiinae Brunner von Wattenwyl, 1865 (seland - recent)
rod Efcookella Merz, Bächli, Haenni & Gonseth, 1998 (eocén - recent)
čeleď Ektopodontidae Stirton, Tedford & Woodburne, 1967 (střední miocén)
rod Elaphidion Audinet-Serville, 1834 (střední eocén - recent)
druh Elaphidion inclusum Vitali, 2007 (spodní miocén)
podčeleď Elaphrinae Latreille, 1802 (lutet - recent)
čeleď Elapidae F. Boie, 1827 - korálovcovití (spodní miocén - recent)
čeleď Elateridae Leach, 1815 - kovaříkovití (oxford - recent)
infrařád Elateriformia Crowson, 1960 (callov - recent)
podčeleď Elaterinae Leach, 1815 (cenoman - recent)
nadčeleď Elateroidea Leach, 1815 (callov - recent)
rod Eledonoprius Reitter, 1911 (rupel - recent)
druh Eleodes gracilis LeConte, 1858 (piacenz - recent)
nadčeleď Empidoidea (cenoman - recent)
rod Endophloeus Dejean, 1834 (priabon - recent)
kohorta Endopterygota Sharp, 1898 - hmyz s proměnou dokonalou (perm - recent)
nadčeleď Enoplometopoidea de Saint Laurent, 1988 - humříci (spodní jura - recent)
rod Eodelphis Murakami, Shimada, Hikida, Soeda & Hirano, 2014 (svrchní miocén)
druh Eodelphis kabatensis (Horikawa, 1977) (svrchní miocén)
druh Eomastixia saxonica (Menzel) Holý (miocén)
druh Eoplatanista gresalensis (Dal Piaz, 1916) (spodní miocén)
druh Eoplatanista italica Dal Piaz, 1916 (spodní miocén)
druh Eoplatanista taurinensis Pilleri, 1988 (spodní miocén)
druh Eosqualodon latirostris (Capellini, 1903) (spodní miocén)
druh Eostyloceros hezhengensis Deng, Wang, Shi, Li & Li, 2014 (svrchní miocén)
druh Eosyncerus ivericus Vekua, 1972 (piacenz)
druh Eotragus artenensis Ginsburg & Heintz, 1968 (spodní miocén)
druh Eotragus clavatus (Gervais, 1850) (střední miocén)
druh Eotragus haplodon (Meyer, 1846) (střední miocén)
druh Eotragus lampangensis Suraprasit, Chaimanee, Chavasseau & Jaeger, 2015 (střední miocén)
druh Eotragus minus Ginsburg, Morales & Soria, 2001 (spodní miocén)
podčeleď Epilamprinae Brunner von Wattenwyl, 1865 (cenoman - recent)
druh Epipremnites ornatus (E. M. Reid & Chandler) Gregor & Bogner (miocén)
rod Epistrophe Walker, 1852 - pestřenka (oligocén - recent)
podčeleď Epuraeinae Kirejtshuk, 1986 (apt - recent)
druh Equus stenonis Cocchi, 1867 (piacenz)
nadčeleď Eremiaphiloidea Saussure, 1869 (miocén - recent)
druh Ergates faber (Linnaeus, 1761) - tesařík zavalitý (piacenz - recent)
podčeleď Eristalinae Newman, 1834 (ypres - recent)
tribus Eristalini Newman, 1834 (ypres - recent)
druh Eristalis miocaenica (Stackelberg, 1925) (miocén)
podčeleď Ernobiinae Pic, 1912 (rupel - recent)
čeleď Erotylidae Latreille, 1802 - trojáčovití (priabon - recent)
podčeleď Erotylinae Latreille, 1802 (priabon - recent)
druh Etruria viallii Abbazzi, Delfino, Gallai, Trebini & Rook, 2008 (svrchní miocén)
druh Euagoras impressus Heer, 1853 (serravall)
tribus Euagorasini Distant, 1904 (serravall - recent)
druh Euboeus mimonti Boieldieu, 1865 (piacenz - recent)
nadřád Eucarida Calman, 1904 - velkokrunýřovci (spodní křída - recent)
podčeleď Euchirinae Hope, 1840 (střední miocén - recent)
druh Eucommia europaea Mädler (svrchní miocén)
rod Euconnus Thomson, 1859 (svrchní eocén - recent)
rod Eucrada LeConte, 1861 (svrchní eocén - recent)
tribus Eucradini LeConte, 1861 (svrchní eocén - recent)
doména Eukaryota Whittaker & Margulis, 1978 - jaderní (proterozoikum - recent)
řád Eulipotyphla Waddell, Okada & Hasegawa, 1999 - hmyzožravci (střední paleocén - recent)
druh Eumecoleus tenuis Haupt, 1950 (střední miocén)
rod Euparius Schoenherr, 1823 (spodní eocén - recent)
druh Euparius elongatus Poinar & Legalov, 2016 (spodní miocén)