Stratigrafické období - taxony
druh Diademaproetus mohamedi Chatterton, Fortey, Brett, Gibb & McKellar, 2006 (ems)
druh Diademaproetus praecursor Alberti, 1969 (ems)
druh Diamenocrinus primaevus Le Menn, 1970 (ems)
druh Dicoelosia dimera (Barrande, 1879) (prag)
druh Dicoelosia praedimera Mergl, 2003 (lochkov)
druh Dicranurus hamatus Conrad, 1841 (lochkov)
druh Dicranurus monstrosus (Barrande, 1852) (prag)
poddruh Dicranurus monstrosus amyklas Vaněk, 1999 (prag)
poddruh Dicranurus monstrosus monstrosus (Barrande, 1852) (prag)
druh Dictyonema crassibasale Gurley in Bassler, 1909 (lochkov)
druh Dictyonema elongatum Bouček, 1957 (lochkov)
druh Dictyonema goepperti Prantl, 1951 (ems)
druh Dictyonema pragense Prantl, 1951 (ems)
druh Dictyonema subregulare Bouček, 1957 (lochkov)
druh Dictyonema subtile Bouček, 1957 (lochkov)
druh Dimerocrinites lemenni Prokop & Slámová, 2008 (ems)
podtřída Dipnoi Müller, 1844 - dvojdyšní (spodní devon - recent)
druh Dualina major Barrande, 1881 (lochkov)
druh Dudleyaspis eva (Pek & Vaněk, 1989) (prag)
druh Dyscritella bohemica Ernst, 2008 (prag)
kmen Echinodermata Bruguière, 1791 - ostnokožci (spodní kambrium - recent)
třída Echinoidea Leske, 1778 - ježovky (ordovik - recent)
druh Edriocrinus ata Prokop, 1976 (prag)
druh Edriocrinus pocilliformis Hall, 1859 (spodní devon)
druh Edriocrinus tara Prokop, 1976 (ems)
druh Eldredgeia eocryphaeus Carvalho, Edgecombe & Smith, 2009 (ems)
druh Elgaecrinus uralicus Rozhnov, 2018 (lochkov)
druh Elicrinus ornatus Prokop, 1973 (ems)
druh Elicrinus procerus Prokop, 1973 (prag)
druh Ellipsocrinus hanusi Prokop & Slámová, 2008 (ems)
druh Elliptostrophia elliptica Havlíček, 1963 (ems)
druh Emanuella laskarewi Kelus, 1939 (devon)
druh Emanuella samsonowiczi Kelus, 1939 (devon)
druh Emanuella volhynica Kelus, 1939 (devon)
druh Entomozoe pinguis (Barrande, 1872) (devon)
druh Eocaudina maccormaki Frizzell & Exline, 1956 (lochkov)
druh Eodrevermannia bouskai (Přibyl, 1946) (prag)
druh Eodrevermannia havliceki Vaněk & Hartl, 1999 (ems)
druh Eodrevermannia rara (Přibyl & Plas, 1954) (ems)
druh Eodrevermannia sirax Šnajdr, 1980 (prag)
druh Eoglossinotoechia cacuminata Havlíček, 1959 (prag)
druh Eoglossinotoechia mystica Havlíček, 1961 (lochkov)
druh Eohalysiocrinus convexus Prokop, 1970 (ems)
druh Eohalysiocrinus cylindricus Prokop, 1970 (prag)
druh Eohalysiocrinus holynensis Prokop, 1970 (ems)
druh Eohalysiocrinus latus Prokop, 1970 (ems)
druh Eohalysiocrinus reticulatus Prokop, 1970 (prag)
druh Eohalysiocrinus tuberosus Prokop, 1970 (prag)
druh Eohormotomina restisevoluta Frey, Naglik, Hofmann, Schemm-Gregory, Frýda, Kröger, Taylor, Wilson & Klug, 2014 (prag)
druh Eoreticularia indifferens (Barrande, 1848) (prag)
druh Eospirifer davousti (Verneuil, 1850) (spodní devon)
druh Eospirifer macropleura (Hall, 1852) (spodní devon)
druh Eospirifer pseudotogatus Chalfin, 1948 (devon)
druh Eospirifer sergaensis Khodalevich, 1951 (spodní devon)
druh Eospirifer togatoides (Paeckelmann, 1925) (spodní devon)
druh Eospondylus primigenius (Stürtz, 1886) (prag)
druh Erbenaspis adoskami Hartl & Vaněk, 2000 (prag)
druh Erbenoceras advolvens (Erben, 1960) (spodní devon)
druh Erbenochile erbeni (G.K.B. Alberti, 1981) (ems)
druh Eremiproetus charops Šnajdr, 1980 (ems)
poddruh Eremiproetus dufresnoyi dufresnoyi (Hawle & Corda, 1847) (ems)
druh Eremiproetus emerita Šnajdr, 1980 (ems)
druh Eremiproetus natator (Barrande, 1852) (prag)
druh Eucalyptocrinites inexplicatus (Waagen & Jahn, 1899) (prag)
druh Eucharitina eucharis (Barrande, 1847) (prag)
druh Eucystis hercynica Jaekel, 1899 (spodní devon)
druh Eucystis robusta Prokop, 1964 (ems)
doména Eukaryota Whittaker & Margulis, 1978 - jaderní (proterozoikum - recent)
druh Eutaxocrinus capella Prokop & Petr, 1987 (ems)
druh Euzonosoma tischbeinianum (Roemer, 1862) (ems)
druh Favosites intricatus Počta, 1902 (prag)
druh Favosites sphaericus Hall (prag)
druh Felinotoechia audax (Barrande, 1879) (prag)
druh Fenestella conopeum McKinney & Kříž, 1986 (prag)
druh Fenestella gracilis (Barrande in Počta, 1894) (prag)
druh Fenestella minuscula (Počta, 1894) (spodní devon)
druh Filihernodia buccina Taylor & Wilson, 2014 (prag)
druh Fimbrispirifer bischofi (Roemer in Giebel, 1858) (spodní devon)
druh Fimbrispirifer charybdis (Barrande, 1879) (prag)
druh Fimbrispirifer daleidensis (Steininger, 1853) (spodní devon)
druh Fimbrispirifer trigeri (de Verneuil, 1850) (spodní devon)