Stratigrafické období - taxony
druh Dicentrus mehli Vitali & Damgaard, 2016 (rupel)
rod Dicerca Eschscholtz, 1829 (svrchní eocén - recent)
druh Dicerca reticulatoides Bellamy, 2003 (oligocén)
podtribus Dicercina Gistel, 1848 (střední paleocén - recent)
tribus Dicercini Gistel, 1848 (střední paleocén - recent)
druh Dicotylophyllum deichmuelleri Z. Kvaček et Walther (rupel)
druh Dicotylophyllum heerii (Engelh.) Z. Kvaček et Walther (rupel)
čeleď Dictyopharidae Spinola, 1839 - čelnatkovití (priabon - recent)
podčeleď Dictyopharinae Spinola, 1839 (priabon - recent)
nadřád Dictyoptera Leach, 1818 (apt - recent)
podtribus Dictyopterina Houlbert, 1922 (rupel - recent)
řád Didelphimorphia - vačice (svrchní křída - recent)
druh Dignoptinus regiomontanus (Alekseev, 2014) (rupel)
nadčeleď Dilaroidea (cenoman - recent)
druh Dilophus luteipennis (Théobald, 1937) (oligocén)
podčeleď Dinoderinae Thomson, 1863 (alb - recent)
čeleď Diopsidae Bigot, 1852 - stopkoočkovití (svrchní eocén - recent)
nadčeleď Diopsoidea Bigot, 1852 (svrchní eocén - recent)
druh Diospyros brachysepala A. Braun (rupel)
rod Diplocoelus Guérin-Ménéville, 1844 (rupel - recent)
druh Diplocoelus probiphyllus Vitali, 2010 (rupel)
druh Diplocynodon muelleri (Kälin, 1936) (rupel)
nadčeleď Diploglossa - slepýšovci (svrchní jura - recent)
podtřída Dipnoi Müller, 1844 - dvojdyšní (spodní devon - recent)
čeleď Diprionidae Rohwer, 1910 - hřebenulovití (priabon - recent)
podčeleď Diprioninae Rohwer, 1910 (priabon - recent)
podřád Discoglossoidei (jura - recent)
druh Ditylus lienharti Theobald, 1937 (rupel)
čeleď Dolichopodidae Latreille, 1809 - lupicovití (eocén - recent)
druh Dombeyopsis lobata Ung. (rupel)
podčeleď Donaciinae Kirby, 1837 - rákosníčci (thanet - recent)
podčeleď Dorcasominae Lacordaire, 1868 (rupel - recent)
podčeleď Dorcatominae C.G. Thomson, 1859 (ypres - recent)
podtribus Dorytomina Bedel, 1886 (rupel - recent)
druh Dorytomus electrinus Legalov, 2016 (rupel)
druh Dorytomus groehni Bukejs & Legalov, 2019 (rupel)
podtribus Dromiusina Bonelli, 1810 (priabon - recent)
druh Dryobius miocenicus Beutenmüller & Cockerell in Cockerell, 1908 (rupel)
druh Dryomyza pelidua Statz, 1940 (oligocén)
čeleď Dryomyzidae Schiner, 1862 - temnomilkovití (rupel - recent)
tribus Dryophthorini Schoenherr, 1825 (svrchní eocén - recent)
čeleď Dytiscidae Leach, 1815 - potápníkovití (berrias - recent)
podčeleď Dytiscinae Leach, 1815 (priabon - recent)
kmen Echinodermata Bruguière, 1791 - ostnokožci (spodní kambrium - recent)
třída Echinoidea Leske, 1778 - ježovky (ordovik - recent)
druh Echinolampas discoideus d'Archiac & Haime, 1853 (oligocén)
čeleď Ectobiidae Brunner von Wattenwyl, 1865 - rusovití (seland - recent)
podčeleď Ectobiinae Brunner von Wattenwyl, 1865 (seland - recent)
druh Ediscetus osbornei Albright, Sanders & Geisler, 2018 (rupel)
rod Efcookella Merz, Bächli, Haenni & Gonseth, 1998 (eocén - recent)
rod Elaphidion Audinet-Serville, 1834 (střední eocén - recent)
druh Elaphidion fracticorne Wickham, 1911 (rupel)
podčeleď Elaphrinae Latreille, 1802 (lutet - recent)
čeleď Elateridae Leach, 1815 - kovaříkovití (oxford - recent)
infrařád Elateriformia Crowson, 1960 (callov - recent)
podčeleď Elaterinae Leach, 1815 (cenoman - recent)
nadčeleď Elateroidea Leach, 1815 (callov - recent)
rod Electrochyliza Hennig, 1965 (rupel)
rod Electrotribus Hustache, 1942 (rupel)
druh Electrotribus theryi Hustache, 1942 (rupel)
rod Eledonoprius Reitter, 1911 (rupel - recent)
druh Eledonoprius incoronatus Alekseev, Bukejs & Sontag, 2020 (rupel)
nadčeleď Empidoidea (cenoman - recent)
druh Empis probolaea Melander, 1949 (oligocén)
rod Encyclopidonia Vitali, 2009 (rupel)
druh Encyclopidonia punctatissima Vitali, 2009 (rupel)
rod Endophloeus Dejean, 1834 (priabon - recent)
kohorta Endopterygota Sharp, 1898 - hmyz s proměnou dokonalou (perm - recent)
nadčeleď Enoplometopoidea de Saint Laurent, 1988 - humříci (spodní jura - recent)
podčeleď Epilamprinae Brunner von Wattenwyl, 1865 (cenoman - recent)
druh Episernus palvenikensis Alekseev, 2014 (rupel)