Je to nejstarší druh stromu - fosilie ginkga se datují do období permu (-280 mil. let), za posledních 150 mil. roků se prakticky nezměnil. Nazývá se proto "živoucí fosilií" (Ch. Darwin 1859), jako např.
Wollemia nobilis nebo
Metasequoia. Olistění je považováno za přechodný typ mezi jehličnany a listnáči. Mezi vyhynulé ginkovité dřeviny patří: G. coriacea, G. adiantoides, G. tigrensis, G. apodes, G. digitata, G. yimaensis, G. gardneri. Největší rozšíření dle četných nálezů v období Jury (-213 mil. let, tj. čas
dinosaurů), ginkgo patrně bývalo jedním z nejběžnějších stromů. Z amerického kontinentu zmizelo před 7 mil. roky, z Evropy před 3 mil. roky.