Jediným podobným druhem je pestrokřídlec západní (
Zerynthia rumina), ale jejich areál výskytu se překrývá pouze v jihovýchodní Francii.
Mezi jejich odlišovací znaky např. patří:
modré zbarvení na zadních křídlech pestrokřídlce podražcového
velké množství červených skvrn na předních křídlech pestrokřídlce západního