V laboratorní praxi jsou používány k rozpoznání jejích cyst následující znaky: zralá cysta obsahuje zpravidla 8 jader (2–16), chromidie jsou zakončeny špičatě až nepravidelně a jsou tenčí než u
Entamoeba histolytica! Bezpečné rozlišení ale zajistí jen zkušený parazitolog!
V čerstvé stolici lze najít také trofozoity (20–30 µm), které je nutné odlišit od E. histolytica především dle způsobu pohybu a struktury jádra. Jádro je viditelné i v nativním preparátu (popř. s kapkou Lugolova roztoku) a karyozom je umístěn excentricky. V cytoplazmě nalézáme velké množství potravních vakuol, které často obsahují ingestované bakterie, ale jen výjimečně erytrocyt.