Sekavky byly původně považovány za jednu z podčeledí čeledi sekavcovitých (Cobitidae: Botiinae). Nalbant (2002) navrhl, na základě některých znaků vnější i vnitřní morfologie, přiřadit této skupině statut samostatné čeledi - Botiidae. Molekulární data (Tang et al., 2006; Šlechtová et al., 2007) tento názor potvrdila a navíc ukázala, že sekavky netvoří ani sesterskou skupinu sekavcovitých ryb. Sekavky by měly být proto nadále brány v úvahu jako samostatná čeleď "Sekavkovití", latinsky Botiidae. České jméno čeledi je odvozeno od rodového jména "sekavka" (Hanel a Novák, 2002)