Geneticky odlišitelná populace nějakého druhu adaptovaná pro určité podmínky prostředí ve kterém se vyskytuje. Nejedná se o platnou taxonomickou kategorii, ačkoliv se v určitých případech částečně může překrývat s definicí poddruhu, avšak v některých případech se může jednat pouze o úzkou populaci relativně malého území v jehož okolí se vyskytují jiné ekotypy v rámci stejného poddruhu/druhu.
Ekotyp má význam zejména v molekulární biologii především u různých modelových organismů, jako jsou například huseníčky, např. huseníček rolní (
Arabidopsis thaliana).