Termín

Odvozený znak.

Apomorfie jsou na rozdíl od plesiomorfií mnohem cennější při kladistické rekonstrukci fylogeneze, protože naznačují příbuznost.
Apomorfie můžeme rozlišit na

autapomorfie = unikátní znaky pro jediný taxon (např. peří pro ptáky)

synapomorfie = sdílené znaky, vyskytující se u aspoň dvou skupin organismů (vyznačují příbuznost, např. běhák u ptáků i dinosaurů, oční víčka u slepýše i ještěrek atp.)