Dodělal jsem možnost u vazeb obrázku a biotopu uvádět autora určení biotopu. Také jsem trochu vylepšil ty funkce pro správce, kterými se fotografie propojují s biotopem. Dále uživatel, který nahraje obrázek do kategorie Biotopy, může sám navrhnout vazbu s biotopem, po potvrzení obrázku administrátorem se fotografie sama přidá na profily biotopů.

Jiří Berkovec [ 07.02.2009 22:54:10 ]: No možná by stálo za pokus napsat panu Chytrému, zda třeba nemá k dispozici nějaký celkový fytocenologický systém pro ČR, který by byl aktuálnější než Moravec. Alespoň mít jistotu že nic lepšího není. Pak bych navrhoval zpracovat fytocenologii prozatím pro ČR (ať už podle Moravce s těmi trávníky od Chytrého nebo celé podle nějakého nového systému, bude-li), a na tom to odladit. Ono to bude dost odlišné než ty současné systémy biotopů, se všemi těmi synonymy a autoritami atp. A pak teprv asi rozšířit o fytocenózy dalších zemí, a dost možná si na to vážně sehnat vždy nějakého odborníka z příslušné země.

Myslím, že nejméně pracné je jako první databázi vložit tu nejobsáhlejší a do ní vpasovávat ty menší, ale s šikovným programem může být pořadí lhostejné. Jak je to Ondřeji? Pak je tu problém sloučení dvou databází s mírně odlišně definovanými vyššími kategoriemi (starší a novější pojetí), to je problém stejný jako třeba v zoologickém systému. O obsahu databází nemusím nic vědět, postačí mi znát slučovací pravidlo. Pak je třeba ty databáze mít, někde mám jen exelovskou tabulku se španělským systémem, Moravec by se musel asi opisovat. Trávníky vyšly (někde jsou na internetu ke stažení!) nově pro ČR, možná již i další části, ty bych určitě z Moravce nepřebíral. Španělskou databázi mohu během několika hodin najít a poslat (možná). Tak co dál?

Já bych to viděla takto: pro začátek vložit systém z Moravce, ten je ovšem jen pro Českou republiku. Pokud budete chtít všechny státy, je tato oblast tak odborně náročná, že na to doporučuji nejlépe fytocenologa z každého státu.
Ten citovaný španělský systém je plně kompatibilní s Moravcem, je tak odlišný proto, že ve Španělsku roste řada jiných stromů a a rostlin než u nás a také tvoří řadu odlišných společenstev, které u nás nejsou.
Někde bych mohla vyhrabat ještě přehled slovenkých syntaxonů. To by snad pro začátek mohlo stačit.
A ta kousavost mě od některých z vás tak trochu mrzí.

Zkusím zjistit.

Snad by stálo zato zjistit, zda Jihočeská univerzita nehostí nějakého proboha fytocenologa.

Jiří Berkovec [ 02.02.2009 23:26:29 ]: V BioLibu ten španělský právě není, jen jsme se tady o tom před dvěma rokama bavili a pak z toho sešlo. Což je na jednu stranu škoda, na druhou stranu by to vážně chtělo předem promyslet tak, aby se do sebe dalo zapojit více těch fytocenologických systému. Ale na to musíme asi vskutku najít proboha nějakého fytocenologa :)

Ivana [ 02.02.2009 15:45:07 ]: Španělský fytocenologický systém nevyhovuje českým potřebám protože vyhovuje španělským potřebám, a že je na Biolibu ani nevím. Biolib se neomezuje pouze na české potřeby. Proč španělské syntaxony neodpovídají českým, tomu nerozumím, ale také mám ten pocit. Z toho pak plyne, že sloučení českého systému s jinými systémy na evropský systém je těžko proveditelné, proto také snahy o to "zamrzly". Jestli to Ivana nebo někdy jiný umí, ať pomůže! O oblast ekosystémové části Biolibu je menší zájem, ale přesto by fytocenologický systém neměl v Biolibu chybět. Proboha, najděme si na to fytocenologa! Já jsem jen internetový maniak.

Ivana [ 02.02.2009 15:45:07 ]:
Máte-li zájem nám s fytocenologickým systémem pomoci, my se rozhodně bránit nebudeme. Jistě znáte spoustu fytocenologů, kteří budou ochotni se biolibu zadarmo ve svém volném čase věnovat.

A ačkoliv mne to samotného mrzí, zatím je stále příšerně mnoho programování a organizace okolo taxonomické části BioLibu, takže tu část okolo lokalit a chráněných území poněkud zanedbávám. Což by se mohlo změnit, pokud by se našel někdo ochotný modul správcovat a připomínkovat jeho současné funkce.

Ivana [ 02.02.2009 15:45:07 ]: To máte samozřejmě pravdu, i proto se nakonec ta fytocenologie zatím nerealizovala. Ale najít fytocenologa ochotného systém do BioLibu zapracovat nebo alespoň dodat aktuální zdroje (aktuálnější než Moravec) se nám bohužel nepodařilo.

Dobrý den. Pánové, ten fytocenologický systém uvádí společenstva ve Španělsku a našim společenstvům často neodpovídá.
Proč si na to proboha nenajdete fytocenologa? Pokud to chcete dělat opravdu seriózně, tak opravdu vřele doporučuji alespoň konzultace s odborníkem. Diskuse v tomto fóru každého odborníka jen přesvědčí, že tomu rozumíte jen velmi, velmi málo a celému projektu to silně ubírá na věrohodnosti.

Ondřej Zicha [ 13.06.2007 20:36:29 ]: Už na tom pracuji.

Jiří Berkovec [ 11.06.2007 19:32:59 ]: Myslíš ty kategorie "I. Floating or rooted submerged aquatic vegetation" atd.? No, možná by šly použít úplně stejně jako v jiných systémech, ale prostě by se jim nepřiřazovala autorita a kategorie - jen název a kód. Klidně tam být mohou.

Jinak to co jsem začal psát vypadalo takto: http://www.biolib.cz/DWN/fytocenologie.c.... Ten první sloupec je tam v podstatě jen proto aby se vědělo co pod co patří, jinak se neimportuje, je mi skoro jedno co tam bude za čísla, já si to kdyžtak nějak upravím aby to šlo jednoduše importovat. Ta synonyma doplníme později, třeba taky nějak automatizovaně. Vzájemné pořadí těch fytocenóz se převezme i do BioLibu, ale samozřejmě to také půjde dodatečně změnit.

Nejúplnější přehled je asi na http://www.ucm.es/info/cif/book/checklist/checklist_b.htm a hlavně jej lze snadno stáhnout - to mohu udělat do exelovské podoby. Pak by se to doplnilo o české Moravcovy asociace. Co s vyššími jednotkami?, které nejsou součástí systému, ale smysl mají.

Zbyněk Sovík [ 05.06.2007 11:00:28 ]: Strukturu by to mělo stejnou jako ostatní systémy biotopů na BioLibu (a navíc by tam byly ty autority a syntaxony) Ono jde asi hlavně o to, aby se to nemuselo ručně přepisovat, z toho stromu na SynBioSys by šly ty názvy zkopírovat, i když by se to taky muselo nějak dodatečně upravit, což klidně udělám. Otázka je, jestli ten jejich systém je nějak všeobecně používaný a jestli třeba obsahuje i ty fytocenózy z Moravce - jinak by to asi nemělo smysl.

Bylo by teda v první řadě třeba prozkoumat, co je ten SynBioSys systém zač (já na něj našel odkaz v nějaké prezentaci pro předmět Fytocenologie tuším na Palackého univerzitě), jestli toho Moravce rozšiřuje, nebo se naopak v něm shoduje jen v částech, zda třeba fytocenózy které jsou zmíněné v převodní tabulce Katalogu biotopů ČR v zadní části, které se nevyskytují v Moravcovi, se nachází v tom SynBioSys. A kdyby se to ukázalo jako nevhodné, tak můžeme vyjít z toho Moravce a časem to rozšiřovat.

A až se dohodneme z čeho vyjít, tak začneme promýšlet jak nejlépe začít :) Ono samozřejmě by to šlo celé postavit přes formuláře na BioLibu, ale připadá mi jednodušší a přehlednější, když se to vytvoří třeba v Excelu (alespoň základní kostra), pak se to importuje a bude se to třeba dodatečně upravovat. Ten vzor pro Excelový soubor bych dodal.

Ondřej Zicha [ 03.06.2007 17:01:53 ]: Mě se detaily také nezobrazují, předpokládám, že je chyba na daných stránkách. Vyjít by se z toho určitě dalo, až na tu pochybnou strukturu webu... takže nevím jak by to bylo s tou "rozumnou importovatelnou podobou" systému.
Osobně jsem nenašel domácí literaturu nebo jiný zdroj, který by Moravce nahradil. Případně jsem ochoten vypomoct s přepisováním, kdyby nezbyla jiná možnost.

Jiří Berkovec [ 03.06.2007 15:25:32 ]: Nějaké převodní tabulky jsou v té knize Katalog biotopů ČR (té co se dá stáhnout i jako pdf). Ale zdá se že to čerpá ještě z o něco novější literatury než Moravec 1995...

Teď jsem našel nějaký evropský projekt jménem SynBioSys Europe, možná by se dalo vyjít z toho:
http://www.synbiosys.alterra.nl/eu/
http://www.synbiosys.alterra.nl/eu/Veget...

Bohužel mi to z nějakého důvodu nezobrazuje detaily stránek ani ve Firefoxu, ani v Opeře ani v IE7, a IE6 se mi odinstaloval při instalaci IE7.... budu to muset prozkoumat z jiného počítače.

Ondřej Zicha [ 03.06.2007 14:32:07 ]: Něco v el. podobě o fytocenologickém systému mám, ale jsou to jen některé asosociace a jejich diagnostické druhy, je to nejen neúplné, ale také asi zastaralé. Zpracovat by se to mělo a jsem ochotem v tom něco udělat, ale nemám ani ten Moravcův přehled. Pak by bylo ještě potřebné zamontovat do toho převodní vztahy mezi různými systémy typizace stanovišť, což je obdoba (z hlediska programu) mezidruhových vztahů.

Vyřešil jsem nějaké resty, takže snad budu mít víc času věnovat se i modulu biotopů. Objevil se požadavek, zda bychom nemohli zpracovat a umístit na BioLib fytocenologický systém. Už pro to dělám nějaké přípravy, např. možnost psát k biotopům autoritu a kategorii (třída, řád, svaz, podsvaz, asociace), ještě mne čeká doprogramovat možnost přidávat k biotopům synonyma.

Ale co nemám je ten fytocenologický systém v nějaké rozumné importovatelné podobě. Mám doma kopii knihy Moravec J. (1995): Rostlinná společenstva České republiky a jejich ohrožení, 2. vydání, ale přepisovat to ručně by asi dalo moc práce. Pokud by se to dalo sehnat elektronicky, bylo by to lepší, případně pokud někdo navrhuje jiný zdroj... Na stránce http://www.kvetena.cz/ nějaký seznam stanovišť je, ale je podle staršího vydání a jsou v něm chyby.
Vytvořil jsem si podle zmíněné literatury akorát testovací soubor (v XLS) s třídami a řády, ale chtělo by to rozšířit o svazy a podsvazy, případně i asociace, protože doplňovat to ručně by bylo asi o dost složitější. Bohužel na to sám nemám čas. Nějaké nápady?